Grâce à sa sobriété et sa perméabilité, le pavillon sublime la collection permanente d’art québécois et canadien, tout en établissant un triple dialogue avec la ville, le complexe muséal et l’église. Le premier s’établit grâce aux nombreuses vues sur Montréal, notamment depuis la verrière du sommet de l’édifice qui offre un lien visuel fort avec le mont Royal, élément emblématique de la métropole. Le deuxième s’organise autour de l’intégration du pavillon Bourgie au Musée des beaux-arts en l’y reliant tant physiquement, grâce à un passage souterrain sous la rue Sherbrooke, que métaphoriquement, par une réinterprétation du même marbre blanc utilisé pour les pavillons Michal et Renata Hornstein (1912) et Jean-Noël Desmarais (1991). Le troisième s’organise autour des espaces d’accueil que le pavillon partage avec l’ancien édifice religieux, mais également par l’esprit qu’il en évoque, autant dans son élévation, prolongée par une ouverture vers le ciel, que par la présence d’alcôves subtilement dessinées autour des espaces d’exposition.

L’annexe à l’arrière de l’église, dont la nef et le cœur ont été transformés en salle de concert de 444 places, a été intégralement reconstruite pour faire place au pavillon. Le bâtiment de six étages, dont deux en sous-sol, forme une série de cinq salles d’exposition superposées invitant les visiteurs à faire un parcours chronologique et vertical. Lien entre le clair-obscur du sous-sol et l’illumination du haut de l’édifice, l’escalier central permet un crescendo de lumière en s’autorisant des percées visuelles de plus en plus importantes sur l’extérieur. Il présente également la typologie du lieu, chacun des niveaux abordant la relation avec l’environnement immédiat via cet escalier et les halls des salles superposés donnant sur l’avenue du Musée.